何腾蛟跳入长江，自以为必死，却神奇般随江水漂流上岸。
时值清军攻破江北四镇，弘光帝被俘，南京政权灭亡。
何腾蛟闻讯痛心疾首，哭干了眼泪。他四处寻找旧部，于长沙汇集部属，焚地告天，誓师抗清。
由此，也可以看出他对大明的忠心。
大顺军被阿济格在九江口击溃之后，李自成原来的属下李锦、郝永忠、袁宗第、蔺养成等人大多南逃，遁入湖南。军队没有粮食，四下里烧杀抢掠。
何腾蛟手里兵少，治不了这些流寇，无奈采取绥靖政策，费了不少劲，把他们招安过来，组成荆襄十三镇兵马。
十几万人，号称几十万，声势挺吓人。
这时候，唐王朱聿键已经在福州称帝，封何腾蛟为兵部尚书，定兴伯。
可这位何大尚书，和史可法史阁部基本一样，文人出身，根本统治不了手下这些闯王余孽。
李锦、郝永忠等虽然投了南明，可是没有人给他们发粮发饷啊，还是靠抢掠为生。
何尚书原来手底下还有一帮兵将呢，这些大明正规军出身的人，根本看不起那帮流寇。
于是彼此之间矛盾日深，甚至互相攻打。
何大尚书对此可以说是毫无办法，只能如史阁部一般，东奔西走，四处调停，以求安宁。至于抗清，实在是没有功夫啊
郝永忠这些人，闯王在的时候就野性难改，如今没了闯王节制，更是无法无天。
抢劫杀戮还剥人皮，简直就是一帮披着人皮的禽兽
搞的湖南湖北赤地千里，民不聊生。何腾蛟的清名，也尽数丧在这帮流寇手里。
当时的湖南百姓，实在是受老罪了，许多百姓主动迎接大清军，为大清军引路，去杀这些该杀的流寇。
您想，就这么一帮比土匪还土匪的家伙，指望他们抗清，那不做梦嘛
隆武政权灭亡后，永历接任，加封何腾蛟为武英殿大学士，加太子太保。
光封官没用啊，何大学士手里没有自己的兵，跟着一帮土匪流寇混，能混出好来么
结果清军打来，他一败再败，败无可败，最后连永历帝也给撵到桂林去了，眼看就要玩完。
何腾蛟逃入广西，会同瞿式耜拼死守卫桂林，以求苟延残喘。
就在这个时候，老天，也或者是朱家老祖宗，大概不忍心看着大明就此亡了，给了永历一个翻本的机会。
江西金声桓、王得仁反正了，接着广东李成栋也反正了，整个南方一下就热闹起来。
孔有德在广西，有后路被截断的危险，他只好撤兵，先去对付金声桓。
瞿式耜、何腾蛟总算喘过一口气来，暗呼阿弥陀佛，“侥幸”
于是，何腾蛟率领手下，现在已经被永历封了什么伯什么侯的刘承胤一般人，趁势反击，夺下只剩了几个文官的全州，这就是所谓的“全州大捷”。
接着，他趁清军撤退，全面反击，一举进入湖南。
那帮看大清军来了，立刻躲起来的流寇，这会功夫又都出来了，纷纷聚集到何大学士身边，拍着胸脯保证，忠于大明，誓死抗清。